Os mestrados em Ensino destinam-se a conferir habilitação profissional para a docência no Ensino Básico e Secundário. Estão regulados por  legislação própria e têm pré-requisitos fixados nos mapas anexos a estes diplomas. Os pré-requisitos são determinantes. Não se candidate sem ter a certeza de que os cumpre.

Cursos de Mestrado de Ensino
ENSINO DE EDUCAÇÃO MUSICAL NO ENSINO BÁSICO (2.º CICLO DO EB)
ENSINO DE FILOSOFIA NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE GEOGRAFIA NO 3.º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE HISTÓRIA NO 3.º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE INGLÊS E DE LÍNGUA ESTRANGEIRA NO 3.º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE INGLÊS NO 1.º CICLO DO ENSINO BÁSICO
ENSINO DE INGLÊS NO 3.º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE PORTUGUÊS E DE LÍNGUA ESTRANGEIRA NO 3.º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE PORTUGUÊS NO 3.º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO
ENSINO DE PORTUGUÊS NO 3º CICLO DO ENSINO BÁSICO E NO ENSINO SECUNDÁRIO E DE LATIM NO ENSINO SECUNDÁRIO