O I2E é responsável pela coordenação de dois cursos de doutoramento na área da educação:
Em associação com a NOVA School of Sciences and Technology e o ISPA Instituto Universitário de Ciências Psicológicas e Sociais.
Disponibiliza as seguintes áreas de especialização:
- Educação, Sociedade e Desenvolvimento
- Formação e Supervisão de Professores
- Literacias e Educação
- Psicologia e Educação
- Inovação em Educação
DOUTORAMENTO EM DIDÁTICA DAS LÍNGUAS
Em associação com a Universidade Aberta e em regime de e-learning.
Disponibiliza as seguintes áreas de especialização:
- Ensino de Alemão
- Ensino de Francês
- Ensino de Espanhol
- Ensino de Inglês
- Ensino de Português Língua Estrangeira
- Ensino de Português Língua Materna